Il Consiglio di Istituto è costituito dal Direttore, da 7 eletti tra i ricercatori/tecnologi e da 2 eletti tra i tecnici/amministrativi. 

Attualmente il Consiglio di Istituto è così composto: 

Antonello Provenzale (Direttore f.f.)

Andrea Irace (Rappresentante eletto Ricercatori e Tecnologi)

Giulio Masetti (Rappresentante eletto Ricercatori e Tecnologi)

Giovanni Monegato (Rappresentante eletto Ricercatori e Tecnologi)

Barbara Nisi (Rappresentante eletto Ricercatori e Tecnologi)

Maddalena Pennisi (Rappresentante eletto Ricercatori e Tecnologi)

Giovanni Ruggieri (Rappresentante eletto Ricercatori e Tecnologi)

Eugenio Trumpy (Rappresentante eletto Ricercatori e Tecnologi)

Letizia Costanza (Rappresentante eletto Personale Tecnico e Amministrativo)

Elena D'Elia (Rappresentante eletto Personale Tecnico e Amministrativo)