L'Unità Operativa di Supporto IGG di Firenze è ospitata all'interno del Dipartimento di Scienze della Terra dell' Università degli Studi di Firenze. I due Centri che hanno dato origine alla Sezione di Firenze erano il CSMGA (Centro di Studio per la Minerogenesi e la Geochimica Applicata) e il CSGACP (Centro di Studio di Geologia dell'Appennino e delle Catene Perimediterranee).

Oltre a questi, l' U.O.S. comprende anche una sede distaccata con alcuni laboratori dell'ex CSMGA situati presso i locali del Dipartimento di Scienze della Terra in Via dell'Arcovata 6.